共青团海南医学院委员会接受中共海南医学院委员会和共青团海南省委的直接领导，是海南医学院共青团组织的最高领导机关。目前设有办公室、组织部、宣传部、文艺部、科技部、实践部、外联部、网络部等 8 个部门，并设有海南医学院团校、海南医学院大学生艺术团、《莘报》社、海南医学院青年志愿者协会、海南医学院社团指导中心等 5 个直属机构，下辖 13 个基层院部（系）团委。共青团海南医学院委员会现在专职团干 5 人，其中书记 1 人。共设委员 13 名，常委 7 名。
共青团海南医学院委员会的前身可以追溯到早先成立的海南省医学专科学校团总支。从成立至今几十年来，校团委随学校的变迁而数易其名，历经了海南省医学专科学校团总支和海南大学医学部团总支的初创时期，医学专科学校团总支和海南大学医学部团总支的艰苦创业时期，也经历了文革的曲折前行。从 80 年代初开始，伴随着改革开放的春风，我校团委也步入了改革发展、开拓进取的新时期。
一直以来，共青团海南医学院委员会坚决贯彻执行党中央和团中央的各项路线、方针、政策，高举邓小平理论伟大旗帜，以江泽民同志“三个代表”重要思想为指导，紧密围绕学校党政工作大局充分发挥校学生会、校社团联合会“一体两翼”的作用，开展形式多样化、内涵多元化、运作自主化的校园文化活动。以校园科技文化艺术节、社团活动月、宿舍文化节、学生课外科研课题立项、“挑战杯”学生课外学术科技作品竞赛、暑期“三下乡”社会实践、青年志愿者行动、“校园之春”文艺汇演等一系列精品活动为载体，以营造校园良好学风、加强大学生思想道德建设和深化素质教育为重心，以坚定学生理想信念、培养学生创新能力、拓展学生综合素质为根本，充分发挥共青团组织、引导、服务、维护青年合法权益的职能和作为学校党政得力助手的作用。
在学校党政和团省委的亲切关怀和全校团员青年的共同努力下，学校团委在 2009 年获得“全国五四红旗团委称号”。学生社团白鸽爱心基金会被全国残联、团中央授予“ 全国百万青年志愿者助残行动先进集体”称号。校园文化建设领域异彩纷呈：2009年我校在全国第二届大学生艺术展演活动中获得“优秀组织奖”；校大学生艺术团的舞蹈《花腰花》获艺术表演类甲级一等奖、工艺设计作品《舂》获全国第二届大学生艺术展演活动艺术作品甲组三等奖。社会实践领域硕果累累，2007年、2009年我校获全国大中专学生志愿者暑期“三下乡”社会实践活动“先进单位”称号；学生课外科研工作取得重大突破：我校两件作品在第十一届“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛全国总决赛中获得三等奖，一件作品在第七届“挑战杯”中国大学生创业计划竞赛中获铜奖。
总结过去，展望未来，共青团海南医学院委员会在海南国际旅游岛和学校“以养生保健产业为龙头，走产学研医一体化”特色发展之路背景下，将坚持“建设、服务、创新”的工作理念，与时俱进不断开拓，继续谱写新时期高校共青团工作的华章。
