基础医学作为海南医科大学历史积淀深厚、实力雄厚的优势学科，是海南省首批重点学科，也是我校最早拥有硕士学位授权点的学科之一。本学科自2002年经教育部批准与北京大学联合培养硕士研究生以来，积累了丰富的研究生培养经验。2013年获批基础医学一级学科硕士学位授予权，并于2014年开始独立招收和培养硕士研究生。

本学科始终立足海南，紧跟国家战略需求，聚焦热带病、地方重大疾病和地方病的应用基础研究前沿，同时致力于热带医药资源的创新开发与利用。经过长期建设，已凝练形成五个特色鲜明、优势显著的研究方向：病理学与病理生理学，聚焦热带高发肿瘤与代谢性疾病的病理生理学机制等研究；病原生物学，依托海南丰富的热带病原体资源、临床热带病病例及热带媒介生物，致力于突破热带病诊疗和防控关键技术；医学生理学，聚焦动脉粥样硬化、主动脉瘤等心血管疾病及慢性肾病的生理学研究；医学生物化学与分子生物学，聚焦海南省高发的肝癌，探索其演进机制、防治策略及临床转化应用；热带分子医学，依托海南省医学科学院、热带转化医学教育部重点实验室等科研平台，聚焦海南热带多发恶性肿瘤、感染性疾病及代谢性疾病的相关研究。

学科拥有一支结构合理、实力雄厚的高水平师资队伍，汇聚了包括中国科学院院士、教育部长江学者特聘教授、国家高层次人才计划入选者、国家杰出青年科学基金获得者、国家优秀青年科学基金获得者、国家级百千万人才工程人选、教育部新世纪优秀人才、全国优秀科技工作者、全国优秀教师，以及海南省高层次领军人才、拔尖人才、南海名家、省优专家及双百人才团队核心成员等在内的众多国家级和省部级高层次人才。并拥有“全国高校黄大年式教师团队” “全国党建样板党支部”和海南新时代高校“双带头人”教师党支部书记工作室等荣誉团队，为学科发展和人才培养提供了有力保障。

学科建设过程中，科研与教学紧密结合。近年来承担国家重大科研项目2项、国家自然科学基金项目21项，发表高水平论文160余篇。学科高度重视研究生教学，构建了优质的课程体系，为研究生提供了包括多门国家级一流课程、省级一流课程在内的基础医学核心课程和跨学科选修课程。

毕业生主要去向包括继续攻读博士学位、进入高校或医疗卫生机构工作，受到用人单位普遍认可，社会反响良好，毕业生就业满意度高，为海南及全国医药卫生事业输送了大批优秀人才。