学院前身为1984年成立的基础医学部，历经四十余年的积淀与发展，现已迈入全新阶段。学院拥有国家优秀青年科学基金获得者1人、海南省C类人才4人，并建有第三批“全国高校黄大年式教师团队”。2024年，学院荣获“全国教育系统先进集体”称号。

学院的基础医学学科为海南省特色重点学科，下设11个教研室，拥有1个省级特色实验教学示范中心、1个教育部重点实验室、2个省级重点实验室、1个联合实验室以及1个全国科普教育基地。学院承担人体解剖学、组织学与胚胎学、生理学、生物化学与分子生物学、细胞生物学、医学遗传学、医学免疫学、病原生物学、病理学、病理生理学、药理学、实验生理学、病原生物学与免疫学实验等课程的理论与实验教学。

学院现开设生物技术本科专业，拥有基础医学和生物学2个一级学科博士与硕士学位授权点，具备完整的本硕博人才培养体系。

学院已形成一支结构合理、水平优良的师资队伍。现有在职教职工204人，其中专任教师146人（占71.6%）。专任教师中，具有博士学位者107人（73.2%），硕士学位者37人（25.3%）；正高级职称42人（28.8%），副高级职称52人（35.6%）；研究生导师50人（34.2%）。

学院拥有国家优秀青年科学基金获得者1人、教育部“新世纪优秀人才支持计划”入选者1人、全国优秀教师1人，并建有一支“全国高校黄大年式教师团队”。

学院建有1个教育部重点实验室（热带转化医学教育部重点实验室）、2个省级重点实验室（海南省肿瘤发生和干预重点实验室、海南省热带脑科学研究与转化重点实验室），以及1个联合实验室（海南医科大学—香港大学热带传染病联合实验室）。

实验教学示范中心涵盖四大平台：病原生物学与免疫学实验室、人体解剖学实验室（人类生命科技馆）、功能学实验室和形态学实验室。中心总面积7300平方米，设有教学实验室53间、细胞实验室2间，可同时容纳1732名学生开展实验教学。设备总资产5848万元，配备3D数字人解剖系统、人体生理实验系统、信息化集成化生物信号采集处理系统、5G-WiFi显微数码互动平台等先进教学设备。

学院现有在校生383人，其中本科生220人、研究生113人、民族预科生50人（截至2025年9月29日）。2023—2025届毕业生平均去向落实率达93.8%，近三年本科毕业生考研升学率为26.06%。

学院注重学生创新能力培养，教师指导包括临床专业在内的学生，近三年获国家级、省级、校级大学生创新大赛项目123项，其中国家级奖项26项、省级奖项22项。学生连续三年在全国生命科学大赛中获得国家级一等奖，近三年在全国大学生基础医学创新研究暨实验设计论坛中获得银奖2项、铜奖6项；2025年在全国大学生医学创新大赛暨“一带一路”国际竞赛本科赛区获国家级铜奖2项。此外，近四年在国际生理学知识竞赛中国区赛中荣获一等奖2次、二等奖2次。