李孔宁

李孔宁，三级教授、博导、海南医科大学生物信息学专业负责人、研究生督导、海南省首批“双百”人才团队（热带疾病组学大数据创新研究团队）核心成员、海南省人民医院（海南医科大学附属海南医院）双聘教授。1989年中国科学院上海技术物理研究所半导体专业研究生毕业，从事生物信息学、智能仪器仪表、显示驱动与控制等从芯片到电路、传感器乃至系统软件研究近40年。

建立了良好的研究生和本科生培养模式，与多个基础医学和临床肿瘤医学科研团队紧密合作。指导的研究生均参与申请专利或软件著作权并发表中国科学院2区及以上的SCI论文，指导本科生、研究生参加竞赛获得多项国家级和省部级大奖。培养的研究生均按时毕业并进入中国科学院、港澳大学、国内外研究机构、高科技公司继续深造或从事研究工作。

曾留学日本、加拿大10年，主持东芝、AMD等研发项目近20项。出国前曾主持完成了国内第一个带有无线数传功能的电子钻井参数监控仪表与系统（被列为1998年度国家火炬计划项目，产品在国内外各大油田推广使用）、血液粘度测试仪、电化学肿瘤治疗仪等项目。发表科研论文50余篇，研究成果连续发表在Theranostics，Aging Cell，Computers in Biology and Medicine，Nucleic Acids Research，Autophagy等杂志, 曾获得Wiley威立中国开放科学高贡献作者奖。有10多项科技创新分别或同时申请了中国、美国、日本、加拿大、欧洲、韩国等国家或地区专利，并被AMD（加拿大）公司、IGNIS创新技术公司（加拿大）等推广应用。出国前曾兼任中国医学物理学会理事，黑龙江省电子学会理事等职。目前兼任中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专业委员会委员、黑龙江省生物信息学会理事、海南省免疫学会肿瘤免疫专业委员会副主任委员。

主持科研项目（近五年）：

1. 国家自然科学基金地区项目，多源数据融合解析胶质瘤衰老相关lncRNA的免疫调控机制，32460161，32万，2025-01至2028-12

2. 国家自然科学基金地区项目，DNA甲基化相关lncRNA在儿童中枢神经系统肿瘤中的免疫调控机制研究，32160152，34万，2022-01至2025-12

3. 海南省重大科技计划项目，基于临床生物样本大数据的肿瘤患者个体化诊疗体系构建-基于肿瘤生物大数据的肿瘤动态演进及调控机制研究子课题，ZDKJ2021040，70万，2021-12至2024-12

4. 海南省重点研发计划项目，肿瘤FOX家族及其关键基因FOXM1的多组学分子特征研究，ZDYF2021SHFZ097，40万，2021-09至2023-09

5. 海南省自然科学基金高层次人才项目，基于泛癌失调ceRNA互作网络解析表观调控lncRNA的功能，820RC637，7万，2020-12至2023-12

6. 海南医科大学科研启动经费，50万，2021-05至2026-04

指导研究生获奖（近五年）

1. 申雨桐（2022级硕士生）等：2024年第九届全国大学生生物医学工程创新设计竞赛三等奖

2. 申雨桐（2022级硕士生）：2025校级优秀毕业论文

3. 李佩虎（2021级硕士生）：2024校级优秀毕业论文

4. 许达华（2020级博士生）：获得海南医学院2023届优秀毕业研究生

5. 陈荔旸（2020级硕士生）：获得海南医学院2023届优秀毕业研究生

6. 蔡佳乐（2022级硕士生）：2023第五届衰老和肿瘤国际会议论文壁报一等奖

7. 许达华（2020级博士生）：2022年博士研究生国家奖学金

8. 蔡佳乐（2022及硕士生）等：2022年国家人口健康科学数据中心“共享杯”大学生科技资源共享服务创新大赛二等奖

9. 蔡佳乐（2022级硕士生）等：2022泛珠三角大学生计算机作品大赛二等奖

10. 李佩虎（2021级硕士生）：2022第四届衰老和肿瘤国际会议优秀论文三等奖

11. 许达华（2020级博士生）：2021第六届国际肿瘤精准医学高峰论坛-美国白细胞生物学会（Society of Leukocyte Biology，SLB）优秀论文奖

12. 徐智洲（2019级硕士生）：2021第六届国际肿瘤精准医学高峰论坛-美国白细胞生物学会（Society of Leukocyte Biology，SLB）优秀论文奖

通讯作者发表SCI论文（近五年）

1. Guoqing Deng# , Peihu Li#, Changwu Li#, Caixia Li#, Yuanping Zhu, Xianyao Jiang, Kang Liao, Yu Wu, Qingchen Wei, Jie Chen, Kongning Li(李孔宁)* , Bo Wang *, Hongyan Jiang*：The SOX1:c.1036A > G:p.M346V variant act as an pathogenic gene in nasopharyngeal carcinoma，Gene，2025.9.7（SCI IF：2.4，3区）

2. Jiale Cai#，Deng Wu#，Dahua Xu#，Fujin Liu#，Peihu Li，Dehua Zheng，Zhizhou Xu，Meng Cao，Yutong Shen，Nihui Zhang，Guanghui Tian，Chengyi Fan，Bo Wang*，Kongning Li(李孔宁)*，Xiaoman Bi*：Integrative Transcriptomic Analysis Decodes the Interplay Between Aging, Senescence, and Cancer，Cancer Science，2025.9.3（SCI IF：4.3，2区）

3. Jiayao Chen, Dahua Xu, Bocen Chen, Shaoqin Jian, Tong Chen, Wenguang Wang, Yingjie Ma, Jing Zhang, Kongning Li(李孔宁)*, Wangwei Cai*, Man Xiao*：Senescent macrophages trigger a pro-inflammatory program and promote the progression of rheumatoid arthritis，International Immunopharmacology，2025.3.6（SCI IF: 4.8,2区）

4. Dahua Xu#, Yutong Shen#, Nihui Zhang#, Guoqing Deng#, Dehua Zheng, Peihu Li, Jiale Cai, Guanghui Tian, Qingchen Wei, Hongyan Jiang, Jiankai Xu*, Bo Wang* and Kongning Li(李孔宁)*: Aging2Cancer: an integrated resource for linking aging to tumor multi-omics data，BMC Genomics，2024.12.18，25（1）:1205 (SCI IF：3.5，2区Top)

5. Dahua Xu1#,Nihui Zhang#,Yutong Shen#,Dehua Zheng#,Zhizhou Xu,Peihu Li,Jiale Cai,Guanghui Tian,Qingchen Wei,Hong Wang,Hongyan Jiang,Meng Cao*,Bo Wang*, Kongning Li(李孔宁)*: Single-cell sequencing analysis reveals the dynamic tumour ecosystems of primary and metastatic lymph nodes in nasopharyngeal carcinoma，Journal of Cellular and Molecular Medicine，2024.10（SCI IF:4.3, 2区Top）

6. Peihu Li^#, Xiaoman Bi^#, Dahua Xu^#, Yuan Meng^#, Yucheng Xia, Jiale Cai, Yutong Shen, Jiaqi Wang, Jiazhu Chen, Lamei Yin, Bo Wang*, Deng Wu*, Kongning Li(李孔宁)*：Activation of the hypoxia response in the aging cerebrovasculature protects males against cognitive impairment，Aging Cell, 2024.6.21 (SCI IF：8.0，中国科学院1区Top)

7. Dahua Xu^#, Peihu Li^#, Chunrui Zhang^#, Yutong Shen, Jiale Cai, Qingchen Wei, Meng Cao, Zhizhou Xu, Deng Wu, Hong Wang, Xiaoman Bi*, Bo Wang*, Kongning Li(李孔宁)*：Development of an m6A-related lncRNAs signature predicts tumor stemness and prognosis for low-grade glioma patients，Stem Cells International，2024.1.9（SCI IF：4.3，中国科学院3区）

8. Dahua Xu^#, Chunrui Zhang^#, Xiaoman Bi^#, Jiankai Xu, Shengnan Guo, Peihu Li, Yutong Shen, Jiale Cai, Nihui Zhang, Guanghui Tian,Haifei Zhang, Hong Wang, Qifu Li, Hongyan Jiang, Bo Wang*, Xia Li*, Yongsheng Li*, Kongning Li(李孔宁)*：Mapping enhancer and chromatin accessibility landscapes charts the regulatory network of Alzheimer's disease，Computers in Biology and Medicine，2023.12.3(SCI IF: 7.7，中国科学院2区Top)

9. Xiaoman Bi^#, Dehua Zheng^#, Jiale Cai^#, Dahua Xu^#, Liyang Chen, Zhizhou Xu, Meng Cao,| Peihu Li, Yutong Shen, Hong Wang, Wuping Zheng, Deng Wu*, Shaojiang Zheng*, Kongning Li(李孔宁)*：Pan-cancer analyses reveal multi-omic signatures and clinical implementations of the forkhead-box gene family，Cancer Medicine, 2023.6 (SCI IF: 4.711，中国科学院2区)

10. Deng Wu^#, Xiaoman Bi^#, Peihu Li, Dahua Xu, Jianmin Qiu, Kongning Li^*（李孔宁）, Shaojiang Zheng*, Kim Hei-Man Chow*：Enhanced insulin-regulated phagocytic activities support extreme health span and longevity in multiple populations，Aging Cell, 2023.3.8;e13810 (SCI IF：11.005，中国科学院1区Top)

11. Dahua Xu^#, Meng Cao^#, Bo Wang ^#, Xiaoman Bi^#, Haiying Zhang, Deng Wu, Chunrui Zhang, Jiankai Xu, Zhizhou Xu, Dehua Zheng, Liyang Chen, Peihu Li, Hong Wang, Yan Liu^*, Hongyan Jiang^*, Kongning Li^*（李孔宁）：Epigenetically regulated lncRNAs dissect the intratumoural heterogeneity and facilitate immune evasion of glioblastomas，Theranostics，2023.3.5; 13(5):1490-1505（SCI IF：12.4，中国科学院1区Top）

12. Dahua Xu^#, Zhizhou Xu^#, Xiaoman Bi^#, Meng Cao, Dehua Zheng, Liyang Chen, Peihu Li, Hong Wang, Deng Wu^*, Jun Yang^*, Kongning Li*（李孔宁）: Identification and functional analysis of N6-methyladenine (m6A)-related lncRNA across 33 cancer types, Cancer Medicine, 2023.1; 12(2):2104-2116 (SCI IF: 4.711，中国科学院2区)

13. Meng Cao^#, Liqiang Wang ^#, Dahua Xu^#, Xiaoman Bi^#, Shengnan Guo, Zhizhou Xu, Liyang Chen, Dehua Zheng, Peihu Li, Jiankai Xu, Shaojiang Zheng, Hong Wang, Bo Wang*, Jianping Lu*, Kongning Li*（李孔宁）: The synergistic interaction landscape of chromatin regulators reveals their epigenetic regulation mechanisms across five cancer cell lines, Computational and Structural Biotechnology Journal, 2022.9.12; 20:5028-5039（SCI IF:6.155，中国科学院2区）

14. Yongsheng Li^#, Sicong Xu^#, Dahua Xu^#, Tao Pan, Guo Jing, Shuo Gu, Qiuyu Lin, Xia Li*, Kongning Li*（李孔宁） and Wei Xiang*：Pediatric pan-central nervous system tumors methylomes analyses reveal immune-related lncRNAs，Frontiers in Immunology，2022.5.4 ;13:853904（SCI IF：8.527，中国科学院2区top）

15. Xiaorong Yu^#, Jiankai Xu*^，#, Dahua Xu^#, Xiaoman Bi, Hong Wang, Yanda Lu, Meng Cao, Wenxiang Wang, Zhizhou Xu, Dehua Zheng, Liyang Chen, Xiaodian Zhang, Shaojiang Zheng*, Kongning Li*（李孔宁）：Comprehensive analysis of the carcinogenic process, tumor microenvironment and drug response in HPV-positive cancers，Frontiers in Oncology，2022.3.22; 12:842060（SCI IF：6.244，中国科学院3区）

16. Shengnan Guo^#, Tianhao Li^#, Dahua Xu^#, Jiankai Xu, Hong Wang, Jian Li, Xiaoman Bi, Meng Cao, Zhizhou Xu, Qianfeng Xia*, Ying Cui*, Kongning Li*（李孔宁）：Prognostic Implications and Immune Infiltration Characteristics of Chromosomal Instability Related Dysregulated CeRNA with Lung Adenocarcinoma，Frontiers in Molecular Biosciences，2022.3.28; 9:843640 （SCI IF：5.996，3区）

17. Ke Xu^#, Dahua Xu^#, Hua Pei, Yunfan Quan, Jun Liu, Li Yin, Xuexia Li, ShenTian, Kongning Li *（李孔宁）and Qianfeng Xia*：Whole Blood Transcriptome Analysis Reveals the Correlation between Specific Immune Cells and Septicemic Melioidosis，Disease Markers，2021.10.13; 2021:6166492（SCI IF：3.434，中国科学院4区）

18. Dahua Xu^#, Shun Ding^#, Meng Cao^#, Xiaorong Yu, Hong Wang, Dongqin Qiu, Zhengyang Xu, Xiaoman Bi*, Zhonglin Mu* and Kongning Li*（李孔宁）：A Pan-Cancer Analysis of Cystatin E/M Reveals Its Dual Functional Effects and Positive Regulation of Epithelial Cell in Human Tumors，Frontiers in Genetics，2021.9.17; 12:733211（SCI IF：4.639，中国科学院3区）

19. Dahua Xu^#, Liqiang Wang^#, Sainan Pang^#, Meng Cao, Wenxiang Wang, Xiaorong Yu, Zhizhou Xu, Jiankai Xu, Hong Wang*, Jianping Lu* and Kongning Li*（李孔宁）: The functional characterization of epigenetically regulated lncRNAs involved in dysregulated ceRNA-ceRNA networks across 8 cancer types, Frontiers in Cell and Developmental Biology, 2021.6.17; 9:649755 (SCI IF: 6.684，中国科学院2区)

发明专利

1. 李孔宁,许达华,王波,郑少江,李霞,姜鸿彦,毕小慢,王红,吴邓：胶质瘤免疫逃逸分子标志物在胶质瘤辅助诊断和治疗中的应用，中国专利：202310181686.8（公布）

2. 许达华,李孔宁,姜鸿彦,王波,毕小慢,吴邓,王红,申雨桐：鼻咽癌干性分子标志物在鼻咽癌辅助诊断和治疗中的应用，中国专利：202310590579.0（公布）

3. 王波,许达华,李孔宁,姜鸿彦,毕小慢,吴邓,王红,申雨桐：用于抑制鼻咽癌干性分子标志物的试剂在制备鼻咽癌辅助治疗药物中的应用，中国专利：202310605486.0（初审合格）

4. 李孔宁; 陈宏; 王利强; 吴宇晗; 一种无创双水平呼吸机远程信号调控系统, 2018-2-2, 中国专利：ZL201720087071.9. (获授权)

5. 王凯; 李孔宁; 一种生物大分子荷质比的测量装置及方法, 2016-4-20, 中国专利：ZL201520863324.8. (获授权)

6. 李孔宁; 郑晟; 王利强; 苗正强; 王栋; 张绍军; 李霞; 一种便携式体征信号监 测装置, 2014-9-17, 中国专利：ZL201420033857.9. (获授权)

7. 李孔宁; 王凯; 夏国杰; 宫滨生; 杜磊; 李霞; 一种电泳成分分析方法和系统, 2 013-4-24, 中国专利：ZL201010263477.0. (获授权)

8. Kongning Li; Gupta Cupertino; Gholamreza Chaji; Arokia Nathan; DRIVING SYSTEM FOR ACTIVE-MATRIX DISPLAYS, 2015-1-20, 美国专利：US 8,937,632 B2. (获授权)

9. G.Eeza Chaji; Kongning Li; Vasudha Gupta; Arokia Nathan; Method and system for driving light emitting display , 2013-6-25, 美国专利：US 8,471,875 B2. (获授权)

10. Kongning Li; Charles Leung; Grigori Temkine; Milivoje Aleksic; Steven ;Turner; Greg Vansickle; Kevin O'Neil Reduced component digital to analog decoder and method , 2011-10-4, 美国专利：US 8,031,093 B2. (获授权)

11. Kongning Li; Vasudha Gupta; G. Reza Chaji; IMPLEMENTATION OF HYBRID DRIVING SCHEME WITH MULTIPLE GAMMA CURVES, 2011-3-9, 加拿大专利：CA 2678509. (获授权)

12. G. Reza Chaji; Kongning Li; Arokia Nathan; IMPROVING THE DISPLAY SOURCE DRIVER, 2010-1-29, 加拿大专利：CA 2637343. (获授权)

软件著作权

1. 李孔宁; 毕小慢; 吴邓; 许达华; 徐智洲; 曹勐：癌症N6-甲基腺嘌呤相关lncRNA综合信息平台 [简称：Lnc2m6A], 登记号：2022SR0677015, 2021-12-07

2. 毕小慢; 李孔宁; 蔡佳乐; 郑德华; 许达华：癌症相关FOX基因家族多组学综合信息平台 [简称：FOX2Cancer] , 登记号：2023SR1200009, 2022-12-07

3. 许达华; 李孔宁; 申雨桐; 蔡佳乐：解析衰老与肿瘤多维组学特征的综合分析平台 [简称：Aging2Cancer], 登记号：2024SR0377198, 2023-05-07

4. 许达华;李孔宁;侯灯磊;蔡佳乐;申雨桐：EasyMeth: DNA甲基化一站式分析平台[简称：EasyMeth]，登记号：2024SR0386112，2024-03-13

5. 李孔宁;李佩虎;毕小慢;许达华：iGTExAging：一站式识别GTEx衰老基因软件[简称：iGTExAging]，登记号：2024SR0643265，2024-05-13