李东伟团队主要从事干细胞与心肌细胞再生基础和应用方面的研究，包括揭示染色质打开关闭介导的细胞命运转变机制，建立高质量干细胞获取的策略和发现调控干细胞来源的心肌细胞成熟度的逆转录病毒靶点的作用机制，为心肌再生修复提供新的靶点。在干细胞命运调控研究和心肌发育机制方面获得系列创新新发型，在国际重要学术刊物如Cell Stem Cell, Nature Genetics, Nature Cell Biology, Cell Reports, EMBO Reports，Nucleic Acids Research等Top期刊发表SCI论文27篇，总影响因子311.92，总引用超1700次。