海南省医学科学院（以下简称“医科院”）是经海南省委机构编制委员会批准、在海南医科大学增挂牌子的机构，与海南医科大学是“一个机构两块牌子”。医科院作为海南省医学领域高层次人才落地的科研支持平台，相对独立运行，创新体制机制，去行政化管理，以学术为本，努力打造成为海南省生命医学领军人才集聚地、青年医学科技人才培育地、生物医药科技创新策源地和高层次学科管理人才孵化地。

海南省医学科学院是依托海南医科大学建设的海南省医学科学研究机构，位于海口市龙华区椰海大道352号苍峄路东侧。医科院已建立相对完整的现代生物学和医学技术体系，并营造了良好的学术氛围。目前，拥有实验动物科学部、蛋白质组平台、代谢组平台、流式细胞分析平台、影像平台、药物筛选平台等功能研究公共技术平台。相关公共技术平台已配备包括单细胞高分辨率质谱、三合一质谱仪、三重四极杆液质联用系统、高分辨率质谱仪、共聚焦显微镜、全光谱影像流式细胞分选仪、多参数流式细胞分析仪、定制化多参数流式细胞分选仪、玻片扫描仪、实时动态细胞成像分析系统、单细胞显微切割仪、单细胞原位空间组学分析系统等高精尖先进科研设备。医科院目前建有四个研究中心，分别是骨科运动系统研究中心、新药研发与转化中心、健康长寿与合成生物学创新中心、海洋药物研究中心。并与校本部、附属医院开展广泛科研合作，在直属附属医院建立基础临床协同创新研究中心。医科院将在海南省政府和海南医科大学持续大力支持下，推动海南医科大学高质量发展，助力海南自贸港大健康事业。